Im März 2006 fand die Gründung der der gemeinnützigen Schkola GmbH statt.

Einstimmig hatten die Mitglieder des Trägervereins für die Ausgliederung votiert, nachdem diese über ein Jahr lang beraten wurde. Die gGmbH wurde so zum Träger aller Schkola–Schulen. Der gGmbH steht ein Beirat vor, der von der Mitgliederversammlung im Juli 2006 gewählt wurde.

Die Schkola gGmbH ist im Handelsregister unter der Nummer HRB 24510 eingetragen.

Der Freie Schulträgerverein e.V. ist alleiniger Gesellschafter und vertritt somit die Gründeridee der Schkola.

Die Strukturveränderung hatte zur Folge, dass die bestehenden Verträge (Schulvertrag, Hortvertrag, andere Vereinbarungen) in die Rechtsnachfolge der Schkola gGmbH übergehen. Zahlungen von Gebühren oder des Schulgeldes bitte nur auf nachfolgendes Konto:

Schkola gGmbH
Sparkasse Oberlausitz-Niederschlesien
Konto: 3 000 107 370
Bankleitzahl: 850 501 00